Qu'est-ce que l'ADN environnemental (ADNe) ?

L'ADN environnemental (ADNe) désigne les traces de matériel génétique libérées spontanément par les organismes vivants dans leur milieu (cellules mortes, sécrétions, poils). Sa collecte dans l'eau ou le sol permet de recenser les espèces présentes sans avoir à les observer ou les capturer.

Comment collecter les échantillons pour une analyse ADNe ?

La collecte est extrêmement simple. Pour les milieux aquatiques, nous fournissons des capsules filtrantes équipées de filtres stériles et des pompes de filtration portatives. Pour les milieux terrestres, des tubes de prélèvement sécurisés permettent de collecter des fèces, du sol ou des poils.

Quelle est la précision de la PCR digitale (dPCR) par rapport à la qPCR ?

La PCR digitale (dPCR) permet une quantification absolue de l'ADN cible sans courbe d'étalonnage. Elle offre une sensibilité accrue de près de 10 fois par rapport à la qPCR classique, idéale pour détecter de l'ADN très dégradé ou des pathogènes à très faible concentration.

GeCoLab travaille-t-il uniquement en Wallonie ?

Non. Bien que nous soyons le laboratoire de référence pour le suivi génétique du Loup en Wallonie depuis 2019, nous collaborons avec des ministères, universités, parcs nationaux et bureaux d'études en France, au Luxembourg et à l'échelle internationale.

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Service 06

Microbiomes et Pathogènes (One Health)

Estimation précise des microbiomes bactériens et détection ciblée d'agents pathogènes zoonotiques via marqueurs génétiques et séquençage NGS / dPCR.

Mis à jour le 2 juin 2026

Séquençage NGS & dPCR

Expertise Microbiome & Pathogènes

L'expertise de notre équipe permet d'analyser les microbiomes bactériens et de détecter des agents pathogènes (zoonoses) avec une précision supérieure aux technologies classiques (One Health approach).

Ces analyses permettent le screening des communautés bactériennes dans les organismes (tiques, rongeurs, chauves-souris) ou l'environnement (eau, sol).

Collecte & Extraction

Extraction d'ADN/ARN de haute pureté à partir de tiques, fèces, tissus ou spécimens de musées.

Analyse & Séquençage

Utilisation du Metabarcoding NGS pour le microbiome ou de la dPCR pour la détection ultrasensible de cibles spécifiques.

Expertise & Rapport

Interprétation par nos experts en écologie moléculaire et remise d'un rapport scientifique détaillé.

Spectre de détection

Bactéries

Borrelia, Bartonella, Yersinia, Bacillus, Leptospira...

Champignons

Batrachochytrium dendrobatidis (Bd) & B. salamandrivorans (Bsal)

Parasites

Macro et micro parasites sanguins et intestinaux

Une collaboration d'excellence

Développées avec l'Institut Pasteur et le CHU de Liège, nos méthodes identifient des bactéries comme Borrelia (Maladie de Lyme), Bartonella, Yersinia, Bacillus, Leptospira, ainsi que des champignons pathogènes (Batrachochytrium dendrobatidis - Bd, B. salamandrivorans - Bsal) et parasites sanguins.

Impact Sanitaire

Pourquoi choisir GeCoLab ?

Technologie de pointeNGS & dPCR.
Rigueur académiqueProtocoles validés par l'ULiège.
Screening completDu microbiome aux pathogènes ciblés.

SensibilitéUltra-haute

TechnologieNGS / dPCR

Questions fréquentes

Quels pathogènes pouvez-vous détecter ?

Nous détectons des bactéries (Borrelia, Bartonella, Yersinia, Leptospira), des champignons pathogènes (Batrachochytrium dendrobatidis, B. salamandrivorans) et des parasites sanguins et intestinaux via NGS et dPCR.

La détection de Borrelia (maladie de Lyme) est-elle possible dans les tiques ?

Oui. Nous analysons des tiques, rongeurs et autres réservoirs pour évaluer la prévalence des pathogènes zoonotiques. Nos méthodes ont été développées en collaboration avec l'Institut Pasteur et le CHU de Liège.

Quelle approche utilisez-vous pour le microbiome bactérien ?

Nous utilisons le metabarcoding 16S NGS (sur NovaSeq d'Illumina) pour caractériser l'ensemble des communautés bactériennes d'un échantillon (fèces, tissu, eau), ou la dPCR pour la détection ultrasensible de cibles spécifiques.

Ces analyses s'inscrivent-elles dans une approche One Health ?

Absolument. L'approche One Health reconnaît l'interdépendance entre la santé des animaux sauvages, domestiques et des humains. Nos analyses contribuent à la surveillance des zoonoses à l'interface faune-humains.

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